01新冠肺炎研究的病理学评价
● HALO数字病理图像分析平台
作为了解新冠肺炎病的工具之一，数字病理学在描述新型冠状病毒攻击人体的机制、了解免疫系统对疾病的反应、指导治疗和影响患者预后方面非常重要。HALO是数字化病理图像分析的领导者，在新冠肺炎的发病机理、疫苗、患者治疗、预后等重要研究工作中，将是您不可或缺的研究助手。HALO数字病理图像分析平台结合HALO-link图像管理平台，可以极大地满足您对组织图像的查看、注释、分析、管理和共享的需求。2020年5月，Indica Labs与美国国立卫生研究院合作推出了在线新冠肺炎数字病理学数据库，用于托管人体组织的高分辨率新冠肺炎相关数字图像。
应用文献概述:
HALO在新型冠状病毒疫苗研究中的应用
仓鼠高剂量鼻内新型冠状病毒感染可导致严重的临床疾病，包括组织中高水平的病毒复制、严重的肺炎、体重减轻和一些动物死亡。
用表达新型冠状病毒稳定刺突蛋白的腺病毒血清型26载体疫苗单次免疫，可引起结合和中和抗体反应，预防新型冠状病毒引起的体重减轻、肺炎和死亡。
这些数据证明了疫苗对新型冠状病毒临床疾病的保护作用。该模型可用于新型冠状病毒疫苗的临床前研究、治疗和致病机理研究。
本文涉及的HALO病理图像分析:在每只动物至少一个肺叶的横断面上，用HALO定量平台进行分析。在多个横截面的情况下，每个肺叶被量化为单个数据点。
多重IHC算法用于定量分析SARS-CoV-N和Iba-1蛋白的阳性细胞和百分比。关于新型冠状病毒RNAscope ISH和Mx1，面积定量用于确定新型冠状病毒反义或有义探针的表达水平和Mx1蛋白在总组织面积中的百分比。
对于MPO和CD3+细胞的定量分析，排除了血管、细支气管、软骨和结缔组织区域。细胞核模块用于定量分析MPO+和CD3+细胞并计算其细胞密度。
在所有定量分析中，每个样本的所有图像都经过人工复查，以确保标记和定量分析的准确性。
参考文献:Tostanoski，L.H .，Wegmann，f .，Martinot，A.J .等Ad26疫苗在仓鼠中预防新型冠状病毒严重临床疾病。国家医学中心。。
HALO在SARS-COV-2感染后免疫事件研究中的应用
本研究调查了SARS-COV-2感染后的免疫事件。从急性炎症状态到感染后4周，非人灵长类动物的肺病理是异质性的。急性期的特征是血液中CD16+单核细胞的快速迁移和肺中CD16+巨噬细胞的增加。
在这项研究中，确定了间质巨噬细胞的两个亚群，一个是与血浆中IL-6水平直接相关的过渡性CD11c+ CD16+群体，另一个是长期存在的CD11b+ CD16+群体。结果揭示了新冠肺炎的细胞机制，并验证了NHP作为免疫治疗试验模型的有效性。
本文涉及的光晕病理图像分析:
HALO软件用于病理变化的定量分析。HALO组织分类器用于识别肺RM和AGM区域中的流体和细胞炎症。根据肺部受累的比例，分别对流体性和细胞性炎症进行评分。参考文献:Fahlberg，M.D .，Blair，R.V .，Doyle-Meyers，L.A .等人,“新型冠状病毒感染的非人灵长类动物中急性、消退性或进行性新冠肺炎的细胞事件”。
新冠肺炎疫苗免疫应答评价
● AID酶联斑点分析仪-ELISPOT
德国艾迪和ELISPOT德国艾迪是全球领先的专业研发和生产酶联斑点分析仪、细胞分析仪、病毒蚀斑分析仪、菌落分析仪、Elispot酶联斑点分析试剂和PCR诊断试剂的公司。ELISPOT是检测和评估疫苗细胞免疫水平的有效方法。公认标准:ELISPOT法在世界范围内被广泛用于监测HIV疫苗研究中的免疫反应。在国际艾滋病疫苗行动计划中，ELISPOT方法被用来评估T细胞功能。
elispot在疫苗研发、疫苗研发和动物实验、表位筛选、免疫效果评价、疫苗的细胞免疫效果评价中的应用
评价疫苗抗原免疫应答的疫苗临床试验
疫苗生产过程中的质量控制和疫苗免疫效果是否一致和稳定的鉴定。
03新冠肺炎疫苗检测蛋白分析
● MSD电化学发光免疫分析技术
MSD在疫苗检测中的应用:
异源免疫打破了新疫苗保护性免疫应答的瓶颈。不同平台的新冠肺炎疫苗在功效、保护期、副作用等方面存在差异。为了最大限度地发挥疫苗接种的效益，疫苗研发组副组长、中国工程院院士王军志探索了不同来源的主要增强策略的有效性，并在小鼠模型中测试了4种主要新冠肺炎候选疫苗在中国临床试验中的不同组合。结果表明，腺病毒载体疫苗免疫后，再免疫灭活/重组亚单位/mRNA疫苗，特别能提高中和抗体水平，促进调节性抗体反应成为主要中和抗体。此外，腺病毒载体疫苗的异源初始加强剂也提高了Th1偏向性T细胞应答。该研究结果为新冠肺炎疫苗的开发和应用提供了新的思路。
中国美国食品药品监督管理局研究所提供并维持无特定病原体的BALB/c小鼠。本研究中使用的四种新型冠状病毒疫苗包括灭活疫苗、腺病毒载体疫苗、重组蛋白疫苗和mRNA疫苗，由不同厂家捐赠。用跨越SARS CoV-2棘突蛋白的四个肽库刺激分离的脾细胞20小时，每孔2 × 105个细胞。每种肽的浓度为5微克/毫升。根据不同的接种组或不同的肽库，收集上清液并合并。将上清液以1:2的比例稀释，然后用MSD V-PLEX促炎试剂盒1进行测定。使用标准曲线计算每个样品的浓度。从受刺激样品的水平中减去未受刺激样品的浓度。
04新冠肺炎研究单细胞测序基因分析
● BD Rhapsody单细胞多组学平台
单细胞测序技术在新冠肺炎患者单核细胞免疫学特性研究中的应用
