办理发动机编号手续，向登记该机动车的公安机关交通管理部门备案。
摩托车可以换发动机，但要依法进行。《中华人民共和国道路交通安全法实施条例》第六条：
已注册登记的机动车有下列情形之一的，机动车所有人应当向登记该机动车的公安机关交通管理部门申请变更登记：
(一)、改变机动车车身颜色的;
(二)、更换发动机的;
(三)、更换车身或者车架的;
(四)、因质量有问题，制造厂更换整车的;?
(五)、营运机动车改为非营运机动车或者非营运机动车改为营运机动车的;?
(六)、机动车所有人的住所迁出或者迁入公安机关交通管理部门管辖区域的。
申请机动车变更登记，应当提交下列证明、凭证，属于前款第(一)项、第(二)项、第(三)项、第(四)项、第(五)项情形之一的，还应当交验机动车;属于前款第(二)项、第(三)项情形之一的，还应当同时提交机动车安全技术检验合格证明：
(一)、机动车所有人的身份证明;
(二)、机动车登记证书;
(三)、机动车行驶证。
机动车所有人的住所在公安机关交通管理部门管辖区域内迁移、机动车所有人的姓名(单位名称)或者****变更的，应当向登记该机动车的公安机关交通管理部门备案。
需要带新发动机的发票和合格证行使证，机动车登记证和本人身份证到所属的车管所去更改。
扩展资料：
更换发动机或车架的：
(一)、持购买发票到市车管所技术部门鉴定，审核、发新号。
(二)、按规定填写的《机动车变更、过户、改装、停驶、复驶、报废申请表》并加盖单位章。新号拓印膜须贴在变更表上；
(三)、持发票及复印件；
(四)、更换车架的，需有检验合格报告单；
(五)、持原车行驶证及标准照片一张。
注意事项：
(一)、《变更表》复印一张由车主保管备用；
(二)、要将所替换的旧件交到指定的物资回收部门。
参考资料：
-车管所参考资料：
-中华人民共和国道路交通安全法实施条例
