自动启停系统故障的原因有以下几种：
1、原因一：一般配有自动启停功能的车辆都是默认开启启停系统的，突然不能用，有可能是误按了车上的自动启停按键，导致系统关闭。我们检查下系统是否被关闭；
2、原因二，如果你的车是手动挡的汽车，那自动启停的启用条件会比较复杂一点，当我们停车的时候，当系统识别到"挂空挡，拉手刹，松离合，"这三个动作后才会启动；
3、原因三，各个品牌的不同车型，自动启停系统的设计也不同，以新帕萨特的自动启停系统为例，它必须要满足一定条件。即必须要安全带系上，然后第二个左前门要关闭，发动机要在启动，所以看看你的使用手册有没有什么注意事项；
4、原因四，以下这些情况下不会启动该功能，发动机未达到正常工作温度、自动空调未达到预设温度、电瓶储电量不够、停车后转动方向、车辆紧急刹车、倒车，大家可以参考以上几点；
5、原因五，自动启停系统故障，可能是因为线路，也有可能是其它原因导致启停系统工作实效，这时候最好到4S店进行检修。
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发动机启停故障怎么办?
引起自动启停系统故障的原因就是：
1、自动启停故障多数建立在控制单元检测到车辆如果熄火后不能正常启动。原因很多，比如电瓶电量不足（自动启停车辆电瓶要求较高），节气门故障等，需要去4S店进行检修；
2、发动机自动启停就是在车辆行驶过程中临时停车（例如等红灯）的时候，自动熄火。当需要继续前进的时候，系统自动重启发动机的一套系统；
3、启停系统的工作原理是，当车辆因为拥堵或者路口停止行进。驾驶员踩下制动踏板，停车摘挡。这时候，Start/Stop系统自动检测：发动机空转且没有挂挡；防锁定系统的车轮转速传感器显示为零；电子电池传感器显示有足够的能量进行下一次启动。满足这三个条件后，发动机自动停止转动。而当信号灯变绿后，驾驶员踩下离合器，随即就可以启动"启动停止器"，并快速地启动发动机。在自动挡车型上，只要一松开刹车，或者转动 方向盘 ，发动机又会马上自动点火，立即又可以踩油门起步，整个过程都处于D挡状态。
大家所关注的“发动机启停故障怎么办?”下面我来为大家进行讲解：
发动机启停故障的解决方法：
1、启停系统的工作原理是，当车辆因为拥堵或者路口停止行进。驾驶员踩下制动踏板，停车摘挡。这时候，Start/Stop系统自动检测：发动机空转且没有挂挡；
2、防锁定系统的车轮转速传感器显示为零；电子电池传感器显示有足够的能量进行下一次启动。满足这三个条件后，发动机自动停止转动；
3、影响启停功能工作原因太多了，电瓶电量不能少于70%温度必须小于65度，安全带需要系，空调不能开启，变速器挡位不是P或R，玻璃加热功能不能启用，方向盘角度不能大于30度，车辆停放的位置不能有坡度，车辆速度必须为0，主驾驶车门不是开启状态，以上一个条件不满足，启停都会失效。
