水库鱼与养殖鱼内在差异比较大，这种内在差别除了味道，还包内脏特征等方面的区别。
1、养殖鱼类由于饲料充足，营养丰富，所以，一般都膘肥体壮，而水库鱼由于在自然环境里充分竞争，有上顿没下顿，常常体型消瘦苗条。
2、人工饲养鱼类体内脂肪含量很高，不但腹腔和鱼肠堆满脂肪，连鱼皮下都可能是厚厚一层脂肪，甚至鱼腩都是脂肪为主。而野生鱼类由于食物匮乏，往往体内脂肪含量很低，鱼肠和腹腔脂肪比较少，鱼肉上的脂肪更少。
3、养殖鱼类由于饲料高脂肪，会导致高胆固醇，胆囊很大，胆汁多且颜色浓重。野生鱼类胆囊小一些，且胆汁没有那么多，颜色相对淡一些。
4、养殖鱼类由于食用人工混合制作的高脂肪高蛋白饲料，且食量大，定期投喂，消化吸收率低，因此，排泄物往往是黑乎乎的，且腥臭味很重。而水库鱼类由于食用纯天然食物，且食物量少，消化很充分，排便颜色浅，腥臭味淡很多。仔细观察鱼池里的水质情况，就能有所察觉。
