1 藻类为养殖动物提供氧气和良好的环境
养殖动物的生存离不开氧气的供应，藻类的光合作用为养殖动物的存活和生长代谢提供了充足的氧气。藻类在一定程度上能净化养殖水质，有研究表明硅藻和绿藻具有吸附有害物质、保持水质“爽、活”的作用，可用来构建优良藻相，从而达到改善水质的目的。在西施舌幼贝养殖中引入固定化微藻后发现，实验组水体中的氨氮和亚硝酸盐明显低于对照组；有文献也报导了底栖藻类对水体中的氮、磷有明显的去除效果；稳定的波吉卵囊藻和微绿球藻不仅可以提高水中的溶氧含量，还能降低水中的氨氮、亚硝酸盐等有害因子的浓度，从而达到净化污水和保持良好水环境条件的作用。
藻类的生长繁殖有改善底质的作用，生活在底层的藻类其光合作用可为底泥中的细菌提供氧气，促进其分解底泥中的有机质，从而间接地改善底质。另外，藻类的繁殖可消耗底泥中过多的氨氮，从而净化底质。
2 藻类为养殖动物提供饵料
藻类特别是微藻含有丰富的蛋白质和氨基酸，是很好的蛋白质来源。有研究表明，螺旋藻的粗蛋白含量高达69.3%，且氨基酸的种类齐全，且由于其细胞壁纤维素含量很少，其所含蛋白质很容易被动物消化吸收。微藻的脂肪含量也很高，检测得到20种微藻脂肪含量大都超过15%，其中金藻门的含量一般均在20%以上。且所含的脂肪酸中有很大一部分为多不饱和脂肪酸，它们是许多水产养殖生物幼体存活和发育的必需脂肪酸，如硅藻门含有丰富的二十碳五烯酸（EPA），金藻门含有丰富的二十二碳六烯酸（DHA）。藻类还含丰富的维生素和微量元素，如生物素，叶酸，钙、镁、铁、锰、铜和锌等，它们是参与养殖动物的新陈代谢中许多酶的辅助因子。
3 藻类可在一定程度上增强养殖动物的抗病能力
有研究表明在凡纳滨对虾养殖水体中引入波吉卵囊藻和微绿球藻，发现对虾的血细胞数目、血清蛋白含量以及酚氧化酶、超氧化物歧化酶、溶菌酶、抗菌酶的活性都较对照组有显著提高。对小球藻的研究表明：小球藻中含有的小球藻生长因子能激活淋巴细胞，增强水生动物机体免疫能力。
藻类的生长可抑制致病菌的生长，从而间接地提高养殖动物抗病能力。研究认为，微藻由于体积小，生长迅速，与水中不良微生物竞争可优先占得生态空间，从而抑制不良微生物例如弧菌的滋生，提高养殖动物免疫力；另一方面，藻类能产生抗生素类物质，可以杀死水中的致病菌，提高养殖动物的免疫力和抗病力。
4 藻类对养殖动物的危害
有些藻类的生长繁殖是对养殖动物有危害的。研究发现一些甲藻（裸甲藻、飞燕角甲藻）在繁殖过程中，可产生多种神经毒素，引起养殖鱼体的神经麻木、代谢失调及呼吸障碍，严重时可导致死亡。水体中的青泥苔（即双星藻科的水绵、双星藻和转板藻等丝状绿藻的总称）和水网藻大量繁殖时，因消耗水体中的养分使水质变得清瘦，也可导致养殖鱼类特别是苗种被缠绕致其呼吸困难或者无法摄食而死亡。养殖鱼塘三毛金藻中毒的鱼体，大多停留在四角及浅水池边，头朝岸边整齐排列，在水下静止不动，无浮头现象，受到惊吓也没有反应；观察死亡鱼体，可见鱼体体表鳍基部充血，鱼体后部颜色变浅；鳃内有大量粘液，鳃丝轻度腐烂；解剖鱼体后发现其肠道无食，无明显病灶。
有的藻类其死亡后分解会产生有害物质，如微囊藻死亡后，其蛋白质分解产生的有毒的羟胺和硫化氢会毒死鱼类。此外，藻类如若大量繁殖，然后迅速衰败，死亡的藻类会在底部不断积累，其腐烂分解会消耗水中大量的氧气，使水体特别是底部严重缺氧，对养殖动物造成不利的影响。
暗棚养殖需要什么藻类
许多水产养殖中通常有藻类。一开始大家都是从对水产养殖有好处的想法开始的。结果，经常发现这种藻类的生长速度出乎意料，造成严重的藻类泛滥。那么，怎样才能抑制这些藻类的繁殖呢？让让我们简单地看一下吧！
1、换水清藻
藻类的繁殖与水产养殖的水密切相关。藻类的主要生长依赖于水中微生物的生长繁殖，所以治水是一个关键的地方。最简单有效的治水方法就是定期换水，然后在换水的时候把池塘里的藻类清理干净，从根本上切断它的繁殖和扩张。但是每次换水都比较麻烦，所以池塘太大太多的话不建议用这种方法。
2、防治水肥
我们都知道，当养殖池塘的藻类旺盛的时候，就说明这个池塘的水质肥沃，营养丰富，那么在这样优质的环境下，底部的藻类自然会旺盛的生长。日常饲料的多余堆积是水体肥化的主要原因之一。这些饲料在水中分解产生的营养可以不会被鱼吃掉，最后它们会慢慢繁殖到水底，成为藻类养料。因此，需要控制每天的投喂量，延长投喂时间，减少饲料的浪费，然后定期清理池底的堆积物质，可以明显防治水肥，抑制藻类的生长。
3、喂养食藻物
其实藻类也可以用生物方法去除。一般喂一些吃藻类的鱼，也是常用的方法。常见的食藻鱼类有鲢鱼、鳙鱼等。可以算是比较厉害的食藻物种，日食量大，所以很多地方都用这种方法。但是在选择这类鱼的时候，一定要注意这些是否可以和自己的主品种混养，提前做好调查，不要吃不必要品种的亏。其次，要测试他们是否吃这种藻类，然后再大规模投放。
4、用药
终于有药了。目前市面上很容易买到杀藻药，但一般的药对养殖的鱼会有一定的影响，很多都是指特定的藻种。用药时要搞清楚对这种藻类是否有效，服药后要做什么处理，对养殖的水产品有什么影响，再用药。如果条件允许，它最好提前做实验。可以选择少量的地方做实验，看看效果再决定。
以上是几种抑制藻类过度生长的方法。你可以选择并尝试它们，看看哪一种更符合自己的养殖模式。适量的藻类对水产养殖有好处，但是如果长的旺盛就不好了。我们必须采取措施抑制它。
部分专业知识转自网络。
小球藻。
暗棚养殖需要小球藻，隶属绿藻门，是一种单细胞藻，能够被幼体和浮游生物捕获、营养成分易吸收。
藻类是原生生物界一类真核生物(有些也为原核生物，如蓝藻门的藻类）。主要水生，无维管束，能进行光合作用。体型大小各异，小至长1微米的单细胞的鞭毛藻，大至长达60公尺的大型褐藻。藻类是原生生物界一类真核生物(有些也为原核生物，如蓝藻门的藻类）。主要水生，无维管束，能进行光合作用。体型大小各异，小至长1微米的单细胞的鞭毛藻，大至长达60公尺的大型褐藻。
