1、木种不同
黄金檀木属于是紫草科破布木属的三出破布木，还属于四白绿叶破布木为中至大乔木，而金丝檀木的木材种属非洲的小斑马木，还属苏木科树种中的一种木材。
2、产地不同
黄金檀木又叫墨西哥黄金檀，产地一般在墨西哥南部，而金丝檀木也叫非洲黄金木，生长于非洲加蓬，喀麦隆等热带雨林地区木材。
3、木材特点不同
黄金檀木的树皮浅灰色，展现出来的是那种整齐的网状纵横裂纹，内皮红褐色，木材端头为圆形，有的为梅花状，非常的有光泽，纹理交错，材质甚重，而金丝檀木的树皮是灰色的，树皮开裂，条纹脱落，内皮赤褐色，木材是那种淡桃褐色的或者是淡黄褐色的，而且也有金属光泽。
区别：硬度和抗菌性能。
1、硬度：乌檀木树龄居长，生长速度缓慢，木材在成熟时比较致密，硬度较高，黄金檀木生长环境较为恶劣，生长速度缓慢，使其木材的密度更高，硬度更强。
2、抗菌性能：黄金檀木含有丰富的挥发性油脂，而挥发性油脂具有一定的杀菌抑菌作用，使得黄金檀木制成的菜板表面对细菌和霉菌等微生物更具有抗拒能力。
